学院现设有山东省产业经济研究基地、山东低碳经济技术研究院和山东理工大学世界经济研究中心、区域发展与规划研究中心、农业与农村经济发展研究中心等5个省级、校级科研机构。
山东省产业经济研究基地负责人：王学真
山东低碳经济技术研究院负责人：董会忠
山东理工大学世界经济研究中心负责人：李平
山东理工大学区域发展与规划研究中心负责人：张红霞
山东理工大学农业与农村经济发展研究中心负责人：高峰
